腎臟巨噬細胞是一群長期定居于腎臟內部的組織固有巨噬細胞，對維持腎臟功能穩態，抗感染和組織修復起到重要的作用。傳統認為，血液循環中的單核細胞是包括腎臟在內組織的巨噬細胞的主要來源，單核細胞可以遷移到組織內部并進一步分化成巨噬細胞。近年來，隨著遺傳譜系示蹤技術的進步，這一觀念受到質疑。目前研究認為，正常機體內大多數組織巨噬細胞來源于胚胎時期，出生后部分組織例如腸道中的巨噬細胞被骨髓來源的外周單核細胞代替，而在某些組織例如大腦和肝臟中，巨噬細胞通過自我更新來維持，不需要外周的貢獻。單核細胞對不同組織巨噬細胞的貢獻具有組織特異性，巨噬細胞的來源和更新是免疫學中重要的基礎問題之一。其中腎臟巨噬細胞的確切來源還不清楚，尤其是不同來源的腎臟巨噬細胞是否有表型和功能差異還未被闡明。

腎臟髓質巨噬細胞的偽足并不是簡單包繞在腎小管周圍，而是部分地嵌入管壁伸入到管腔；穿管過程也很奇特，它們直接穿越了胞體，而不是從細胞間的縫隙鉆過。如圖所示，腎臟髓質巨噬細胞長長的偽足伸入管腔。尿路里存在“管道清理工"，即腎臟髓質巨噬細胞，清除腎小管內顆粒物從而避免尿路堵塞，這有望對腎結石等疾病提供新的預防和治療方案。科學家可以尋找特殊的藥物分子，去靶向增加腎髓質巨噬細胞的跨管偽足發生和細胞向管內的遷移行為，從而提升腎小管內顆粒物的清除效率。腎巨噬細胞在監測尿液內容物和促進尿液沉積顆粒的清除方面發揮著重要作用，這一特征的潛在利用可能有利于開發腎結石和腎臟特異性藥物輸送的治療方法。